As análises genômicas têm ganhado lugar de destaque em praticamente todas as áreas que lidam de algum modo com organismos vivos, seja para evitá-los, para confirmar sua presença ou para o entendimento do potencial genético e características de interesse. A popularização das plataformas de sequenciamento de nova geração (NGS) - que produzem dados de sequências biológicas em larga escala -, permitiu a geração de mais de 6 Exabytes de dados, razão pela qual a demanda por bioinformatas preparados para analisá-los tem crescido de forma acentuada, sendo uma profissão do presente muito bem paga e importante para o desenvolvimento científico.

Além disso,  saber lidar com dados biológicos de sequenciamento pode efetivamente ser um diferencial em toda a sua carreira de pesquisa em qualquer área relacionada.

O "Curso Prático de Bioinformática Aplicada à Genômica de Procariotos" será um programa intensivo ministrado pelo Analista em Bioinfo Daniel Caligari, e realizado em parceria com a Helix Biotecnologia. O objetivo é fornecer aos participantes habilidades e conhecimentos necessários para realizar a análise dos dados de sequenciamento de genoma completo de procariotos, realizando anotações gerais e específicas (ex: genes de resistência e virulência, clusters de biossíntese de moléculas de interesse), utilizando as ferramentas e técnicas de bioinformática adequadas e recentes.

Com uma abordagem hands-on, os participantes serão guiados em uma jornada que colocará o mínimo de tempo necessário nas questões de introdução e teorias, que é o que geralmente é apresentado nos cursos de introdução à bioinformática...

Aqui, concentraremos o tempo para a parte prática!

Isto significa que, após uma rápida introdução conceitual abrangente, os alunos irão aprender os pontos específicos da análise de dados de sequenciamento de genoma completo, fazendo ativamente esta análise - do zero ao genoma montado, anotado e analisado.

O conteúdo será ministrado pelo Biólogo Prof. Daniel Caligari, o qual realiza pesquisas em biologia molecular desde 2016 e está há 4 anos trabalhando com análise de dados de NGS baseado em amplicon (perfis de 16S e ITS) e de genoma completo (Shutgun sequencing) de bactérias no setor privado. 

Detalhes do curso:

- Data de realização: 15/06/2024 | Horários: 09:00 às 12:00 e 14:00 às 18:00;

- O curso será realizado pela plataforma Zoom, ao vivo, com interação aberta aos alunos;

- Será fornecido material em PDF com a sequência das aulas, assim como script com os comandos para replicar as análises que foram aprendidas;

- Será emitido certificado de 7 horas (relativo à presença nos dois períodos)

Conteúdo programático:

Sessão 1: 09:00 - 12:00

- Contextualização da área e introdução aos conceitos necessários para nivelamento do conhecimento;

- Configuração do computador (Instalação do linux e todos os programas e ambientes necessários);

- Obtenção e análise dos dados brutos | trimagem, filtros, retirada de adaptadores, classificação taxonômica| Controle qualidade pós-trimagem;

Sessão 2: 14:00 - 18:00

- Montagem dos contigs | análise de qualidade da montagem | Anotação do genoma;

-  Análise de identidade média, scaffolding | Mapeamento das reads contra referência;

- Identificação taxonômica do genoma;

- Conteúdo-bônus descritos abaixo e discussão dos resultados:

#Bônus 1 - Anotação de potencial genético para: resistência a antibióticos, presença de bacteriófagos integrados; clusters para biossíntese de metabólitos secundários; potencial de virulência e identificação dos plasmídeos.

#Bônus 2 - Criação de mapa genômico interativo e permanente e comparação dos scaffolds visualmente contra genoma referência;

Requisitos: Um computador com acesso à Internet, com no mínimo 8GB de RAM e processador com no mínimo 4 núcleos (Se você não tiver estas informações, ou se não tiver um computador com estes requisitos, você poderá acompanhar o curso normalmente, porém talvez não consiga realizar todas as análises).

O público-alvo deste curso são: estudantes de graduação e pós graduação dos cursos relacionados à Biotecnologia, Biologia, Biomedicina, Bioquímica, Farmácia, dentre outros relacionados.

Para dúvidas ou informações, mande um e-mail para: contato@helixbiotec.com.br